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Divergence fonctionelle et génomique des populations au sein et entre deux espèces de killies adaptées à des niches osmotiques différentes

jeudi 20 février 2014, par webmaster

Références
-*Titre d’origine : FUNCTIONAL AND POPULATION GENOMIC DIVERGENCE WITHIN AND BETWEEN TWO SPECIES OF KILLIFISH ADAPTED TO DIFFERENT OSMOTIC NICHES
-*Auteurs : Genevieve M. Kozak1, Reid S. Brennan2, Emma L. Berdan3, Rebecca C. Fuller1, Andrew Whitehead2
-*Source : Evolution, 68 : 63–80. doi : 10.1111/evo.12265
-*Publication : © 2013 The Author(s). Evolution © 2013 The Society for the Study of Evolution.
-*Langue : English

L’adaptation à la salinité affecte la répartition des espèces , la promotion de la spéciation , et guide de nombreux modèles évolutifs chez les poissons . Pour découvrir la base d’un caractère complexe comme l’osmorégulation , des analyses au niveau du génome sont sensibles. Nous combinons les analyses génomiques des populations au profilage de l’expression du génome pour découvrir des gènes candidats et les voies associées à la divergence entre les environnements osmotiques . Nous avons comparé la divergence de la séquence transcriptome entre plusieurs populations d’eau douce et d’eau salée du killi Lucania parva . Nous avons également comparé la divergence de séquence entre L. parva et son espèce sœur ,Lucania goodei , un spécialiste de l’eau douce . Nous avons trouvé des polymorphismes nucléotidiques simples ( SNP ) très différenciés entre les populations d’eau douce et d’eau salée de L.parva à la jonction des cellules et les gènes de transport d’ions , y compris de type V H + ATPase . Entre les espèces , nous avons constaté une divergence dans les gènes de reproduction et de stress osmotique . Les gènes qui ont été exprimés de manière différente entre les espèces au cours de l’acclimatation osmotique inclus des gènes impliqués dans le transport des ions et la régulation du volume cellulaire . Des ensembles de gènes qui étaient divergents dans la séquence de codage et ceux divergents dans l’expression ne se chevauchent pas , même si ils convergent par leur fonction . Comme de nombreuses études utilisant des analyses génomiques , notre approche peut manquer certains loci qui contribuent à l’adaptation , mais ont des modèles compliqués de variation allélique . Notre étude suggère que l’expression du gène et la séquence codante peuvent évoluer indépendamment pendant que les populations s’adaptent à un défi physiologique complexe .

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